Akademickie kształcenie politologiczne w Gdańsku zostało zapoczątkowane ponad 40 lat temu w roku akademickim 1963/64, poprzez utworzenie Studium Nauk Politycznych na Wydziale Humanistycznym w Wyższej Szkole Pedagogicznej w Gdańsku. 20 marca 1970 roku utworzono na bazie Wyższej Szkoły Pedagogicznej i Wyższej Szkoły Ekonomicznej Uniwersytet Gdański i zarządzeniem Ministra Oświaty i Szkolnictwa Wyższego z dnia 9 kwietnia 1970 roku przekształcono Studium Nauk Politycznych w Instytut Nauk Politycznych wchodzący w skład Wydziału Humanistycznego. Zarządzeniem Rektora Uniwersytetu Gdańskiego nr 5/R/90 w sprawie zmian w strukturze organizacyjnej Uniwersytetu Gdańskiego z dnia 24 stycznia 1990 roku przekształcono Wydział Humanistyczny w dwa wydziały: Wydział Filologiczno-Historyczny i Wydział Nauk Społecznych. Instytut Nauk Politycznych po przekształceniu wchodzi w skład Wydziału Nauk Społecznych. Uchwałą Senatu Uniwersytetu Gdańskiego z dnia 30 kwietnia 1992 roku w sprawie zmian organizacyjnych na Wydziale Nauk Społecznych z dniem 31 lipca zlikwidowano Instytut Nauk Politycznych i w jego miejsce z dniem 1 czerwca 1992 roku utworzono następujące katedry:

- Katedrę Historii Najnowszej i Myśli Politycznej XIX i XX wieku

- Katedrę Międzynarodowych Stosunków Politycznych

- Katedrę Politologii Stosowanej

- Katedrę Systemów Politycznych

- Katedrę Nauki o Cywilizacji

Instytut Politologii w obecnym kształcie został utworzony 25 kwietnia 2002 roku na podstawie Uchwały nr 91 Senatu Uniwersytetu Gdańskiego i stanowi część Wydziału Nauk Społecznych.

W ciągu ostatnich pięciu lat w Instytucie Politologii zostały dokonane istotne zmiany. Powołano Instytut Politologii,. Wzbogacono kadrę samodzielnych pracowników naukowych. Wypromowano 32 doktorów, w tym 8 pracowników Instytutu, a jedna osoba uzyskała tytuł doktora habilitowanego. Dokonano zmian w programach studiów. Instytut pozyskał nowy budynek. Powołano 3-letnie dzienne i zaoczne studia licencjackie. Nawiązano nowe kontakty międzynarodowe. Zorganizowano 3 konferencje metodologiczne. Rozwinięto forum dyskusyjne z udziałem polityków. Zorganizowano olimpiady przedmiotowe dla szkół średnich.